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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已提示出丰富的微生物化学活化，涉及到抗肿癌和抵抗疾病毒用。经常，三萜是凭借甲羟戊酸渠道获得的，并从天然冰树种和真菌感染中获取。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上刊出了名为“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的深入分析论文提纲。该深入分析看到三萜类有机物虫草粉酸（GA）是在介质激发的无柄虫草粉菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的动物转换出现的。利用转录组和淀粉酶质组学技木进三步思考无柄野生野生灵芝菌丝体中DHT出现这两种野生野生灵芝酸（GA）的措施，并依据几组学技木探测到的不同遗传基因和不同淀粉酶，得出DHT 动物结合 GA 的行业。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录酚类化合物析和功能表分为

经过对无柄灵芝粉真菌感染菌丝体实施转录组测序共得以67230个转录本和14296个单染色体。在哪些单染色体中，49两个被检测为地域差异抒发染色体（DEGs），这当中213个抒发上涨，279个抒发下跌（图1A）。GO含有分享后，DEGs包括海洋生物阶段（BP）、受损細胞化学成分（CC）和原子核功效（MF）3类。在BP种类中，显示了前八个子种类：抗菌素化解新陈分泌阶段，乙酸盐新陈分泌阶段和甲酸盐新陈分泌阶段;而在CC种类中，受损細胞外区、突触pp体、突触结构的是前八个亚类。对MF种类，甲酸脱氢酶（NAD）活力、脱色还原成酶活力和酸氨（或酰胺）连入酶活力是前八个亚种类（图1B）。在DEGs的KEGG通道分享中，前30条含有度最高的的通道中含27条都是新陈分泌，这当中甲烷气体新陈分泌、乙醛酸盐和二羧酸盐新陈分泌、丙酸盐新陈分泌预警通道相关系数含有（图1D）。

图1|转录混合物析和职能几大类

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

借助对无柄灵芝粉病菌菌丝体采取血清质组学研究深入讲解，加起来决定了16,457种奇特肽、2606种血清质和2588种参考值血清质。在阈值法|FC|>1.2和p<0.05的选择条件下，在这些2606种血清质中，94种被签定为文化不一致性表明血清（DEPs），进来52种上涨，42种变动（图2A），图2C彰显了文化不一致性表明血清的聚类深入讲解研究深入讲解热图。从GO研究深入讲解看来，BP种类彰显，绝大而言数DEPs参与者乙酸盐产生率工作、四环素细化的产生率工作和药材细化的产生率工作。CC类DEPs在体上皮组织神经细胞外区、过空气非金属防氧化物酶体和微体中占分配比例较高，空气防氧化还原成酶吸附性和甲酸脱氢酶（NAD）吸附性在MF类中DEPs的分配比例较高（图2B）。与转录组报告类同，KEGG通道研究深入讲解彰显，非常多DEPs在产生率中含有，进来3条最含有的有效途径是光合微生物制品中的碳规定、碳产生率和MAPK走势通道（图2D）。最后，借助研究深入讲解GO大数据库显示的CC对DEPs采取亚体上皮组织神经细胞追踪定位研究深入讲解和批注（图2E），DEPs主耍遍布在体上皮组织神经细胞质（40.66%）、体上皮组织神经细胞（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），理论与实践上是GAs微生物制品聚合的主耍的位置。

图2|核脂肪酸组的化学发光法数据分析和职能印证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

谋生物转换和對照组待选DEGs和DEPs加工制作了维恩图，有20个差别表现什么是dna组（图3A）。对转录组和核球球蛋白组中E组和C组共分的DEGs/DEPs开展聚类讲解讲解，发展mRNA和核球球蛋白彼此有13个上浮什么是dna组和3个降低什么是dna组，DEGs与其说译为的DEPs表现水准呈正一些，应用场景Pearson的一些指数讲解，在转录组和核球球蛋白组彼此在线检测到相对而言较高的一些性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）检查但是表现，E组和C组115个DEGs的抒发出来含量对比更为明显，这当中9个为上涨DEGs，多个为调整DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的抒发出来动向与转录成分析但是同样。

图3|蛋白酶质组的降钙素原检测分享和实用功能查证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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