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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于免疫抗体鱼类特情人、寡核苷酸掩盖资金昂贵或方法程序流程缜密。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教导项目团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低投入、跨鱼类、全渠道兼容的全新解决方案。

中文核心期刊筒介

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由中华完美院隐性基因与发育成熟生态学学探讨方案所和中华隐性基因协会主办者的國际科研论文刊物,秉承于新闻报道微分子生物学完美和医药学隐性基因学这个这个前沿技术的亿人性探讨方案科技成果。JGG 2026年度直接影响指数7.1,Scopus科研论文刊物如何评价的指标CiteScore 9.9,跻身JCR 2026年度GENETICS & HEREDITY这个这个前沿技术Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY这个这个前沿技术Q1区,跻身中华完美院论文刊物设计布局生态学学大类别1区(Top论文刊物),隐性基因学和分子生物学化学与原子生态学学小类双1区。

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这些是HEATag

幽默的“二三合一”结构设计

HEATag是由凝集素和HUH内切酶产生的融成血清

「市场定位器」信息模块 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化掩盖(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「进行接插件」模组 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)指数长形码开始共价相连。

“1+1>2”的效率:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样本量标签与追溯。

Fig1: HEATag几吨符号远离举手图

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实际战斗考验

HEATag究竟有大多能打?

可能在有所差异状态下,控制喂乳部分动物神经内部系单神经内部混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。科学研究拜谱生物为 HEATag 布置了多轮 “压测试图片”,从神经神经细胞系到神经神经细胞结构,从底温到底温,从新鲜子范例到放置子范例,全座向核实它的安全稳相关性和不靠谱性。

一号轮自测而对辅乳植物上皮生殖生殖细胞系:的研究工作员选择了基人、鼠、仓鼠八个动物群的4种上皮生殖生殖细胞(HEK293T、K562、MEF、CHO),在室内温度下使用 HEATag 标签后搅拌测序。决定回收处理的 11447 个上皮生殖生殖细胞中,85.66% 都能实现 HEATag 方形码准确的一致性到原动物群,子样本间是交叉弄脏很少,UMAP 聚类算法具体分析更加随便声明书,HEATag 方形码与动物群特男人表观遗传组表现形式层面一致性。 接下来,测试测试状态进几步提升等级:研究分析人士试着在 4℃下标示符号清新上皮受损癌癌细胞系、在室内温度下标示符号甲醇一定上皮受损癌癌细胞系,竟然会直接标示符号上皮受损癌癌细胞系核。然而依旧出众:几乎所有状态下,范例那些固化的标签与外来物种消息均体现了非常好的有关性,拆成更准率超 95%。倘若甲醇一定会出现轻度的转录本交叉点污染源,上皮受损癌癌细胞系核分离纯化也有少许 RNA 流失量,上皮受损癌癌细胞系方式的参考文献标注然而依旧与清新范例持续完全一致,证明信 HEATag 会标示符号不相同补救状态下的进行实验范例。

Fig2: HEATag 可在区别条件下顺利完成单细胞系转录组混样浅析

可标记图片乳期节肢甲壳动物和大海无脊椎骨节肢甲壳动物的原代内部

如说血细胞系系测试测试是 “基础框架题”,那组织性样板还是 “额外增加题”, 等等样板必然因血细胞系内型复杂性、生态环境认知性专项 ,被选为图标技術的 “关键点”,而 HEATag 刚好在等等 “关键点” 上呈现了优越性。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸企业,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不能被精准的界定,很多常见細胞性质的聚类算法結果都清淅可辨。

更令人惊喜的是HEATag对浮游生物体生物体的自适应性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长形码与种类转录组体现了较高不符性,没了存在因高盐场景形成的 “图标不起作用”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可满足母乳喂养甲壳动物组建样版重量 scRNA-seq 分折

Fig4: HEATag可变现最新鲜浅海无脊椎骨食草动物几斤 scRNA-seq 深入分析

HEATag与生殖细胞的搭配就不会致使转录组的相关系数转换

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在到位标注工作的还,都不会对事件调查的转录类物质析引发要素,保障了设计大数据的真人真事性。

Fig5: HEATag没有后果子样本的 RNA 展示模式英文

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未来的发展可期

HEATag 能为单人体细胞探究提供任何?

HEATag 的价值观,远不只是于 “满足图标疑问”,它的利索性和普遍性,现在为单癌细胞探讨打開非常多必要条件

从使用情景分析

HEATag 能包裹从 “简约更了解”(如癌阻止与很正常阻止、药清理与比较)到 “大面积探索”(如阻止体生殖细胞图谱画出、高通骁龙量建立)的全范畴要。现在 PIP-seq、Stereo-cell 等新型的可括展技术应用的快速发展,HEATag 还能进几步大幅提升单体生殖细胞探索的通量,机械助力科学研究好项目团队积极开展大些面积的好项目。

从跨教育领域提升空间看看

HEATag 不止适用人群于转录组学,还能与表观遗传基因组学、蛋清质组学、前景组学等枝术设备切合,依据定制开发目录和寡核苷酸队列,HEATag 都可以高效渗透各个的组学程序流程,不危害电磁波捕捉广度。而且,因为HEATag还都可以发展趋势单受损细胞糖组学钻研枝术设备。

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进行合作日常动态

拜谱生物技术与陈凯客座教授形成阶段配合意想

什么值得关心的是,在 HEATag 技術塑造出惊人利用前景的大环境下,拜谱菌物制品工程项目已与南方城市深海科学课与工程项目湖南省科学化验室(杭州)陈凯专家获得大概协议意愿。对方计划书着力 HEATag 技術的财产化落地实施、研发转化成等方向上实现强度优势互补,推动这种成本分析投入、跨种类的单组织细胞膜系箭头技術快些利用于真正研发场所,为比较多科学化验室出示高、经济发展的单组织细胞膜系科研管理软件工具,推助研发事情者在组织细胞膜系菌物制品工程项目学、深海菌物制品工程项目学、的疾病缘由等领域完成比较多超出
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