
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应修饰语球蛋白组学产品,实现1000+玄妙度淡化位点排除,稳定性高重新金典靶点,全东南方向生信进行分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“发现”到“确认”全步奏服务管理,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、研究步奏
02、试验数据表格
03、经“点”显现
在试验数剧中,查出多论文参考文献中新闻稿的传统靶点及衣康酸掩盖位点,如最个被挖掘的衣康酸共价掩盖淀粉酶KEAP1,仍有糖酵解环路中的3个首要酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,各类炎性小体结构淀粉酶NLRP3和細胞病变过程中中的首要淀粉酶RIPK3等,其质谱图方式图提示。
04、车辆特别
1.多种质控
商业服务化特情人电极孵育、SDS-PAGE加测、WB验证通过、子样本想关性概述等各个位加测,确保建设项目结局耐用性。2.高耐腐蚀性质谱测量仪器app平台
在Orbitrap Astral全新几代高鉴别质谱仪支持下,保证衣康碱化修饰语位点及淀粉酶鉴定费新长度,电子助力地理学理论研究新出现 。3.全注意事项站台式售后服务
体系结构拜谱生物制品成熟的實驗网络平台,可提供数据“神经细胞陪养→测试探针孵育→WB在线检则→艰深度衣康硝化作用遮盖在线检则→特权生信了解→相关位点PRM验证通过”全步骤服务性,省时省时更高效。05、了解內容(组成部分)
06、采用导向
PART 2、文献综述转发
学术论文一
英语怎么说网站标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
常常网站标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
探索资源:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
专著二
英文版主题词:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
中文翻译主题词:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
理论研究知识:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、例案繁衍想法
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13存在比较强的底物综合能力素质,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱微生物衣康酸性反应体现组测试数据文件中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应表达(相应图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱个人总结
为TCA循坏中的里边分解消化吸收物,衣康酸调低分解消化吸收、免疫性性性和慢性炎症病变彼此之间之间的彼此之间用途,为制疗免疫性性性慢性炎症病变性问题具备了替代品制疗方案。衣康酸机构中的亲电性α,β-不过剩羧酸机构能对膳食纤维质上的活力半胱氨酸残基做好烷基化突显(迈克尔加上反應),这些汉语翻译后突显被喻为“衣康酸突显(itaconation)”,转而引响膳食纤维质性能,自我调节免疫性性性回话和分解消化吸收经过,为好几种问题药品研发项目管理具备新设想。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化突显淀粉酶组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学界绝对的降钙素原检测靶向药物分解代谢组(QMT1000)或消耗的能量细胞分解靶点细胞分解组新产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
考生医学文献
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.