草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿系統最易见的消化道疾病之三。肾团体中CaOx纳米线过达到饱和状态的堆积会出现肾小管肿瘤细胞磨损和凋亡，因此出现肾结石的演变成。短链皮下脂肪含量酸由肠胃内活性污泥法菌厌氧发酵膳食结构氯纶所产生，既在小面积的肠胃障壁中充分调动用，还有在系統平均水平上也充分调动至关重要用。表中，丁酸是最多样的短链皮下脂肪含量酸，包括抗体减缓和抗体减缓用,本钻研探析丁酸对CaOx肾结石的用下列不属于存在靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山机构泌尿整形外科吴忠专家、周子健研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠先生、周子健院士在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱海洋生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网洛药学学服务性，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

一篇文章简称：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 客服企事业单位：华山医院专家 研究方案對象：大鼠、HK-2生殖细胞 分类产品信息：差表组（Con）、三维模型组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱展示技术设备：网咯药学学测量

难点流量图

学习数据

科学探讨职工要共建大鼠类别，在身体什么是生化质量指标和进行病检学染色剂等科学探讨具体方法出现 丁酸需要削减CaOx类别大鼠肾CaOx硫化锌的养成和挫伤，持续改善CaOx类别大鼠的真菌感染挫伤和脱色有机化合物的过早表答。不仅而且，丁酸还可遏制草酸引导的HK-2細胞挫伤、脱色应激状态和細胞凋亡。 为洞察浅析一下丁酸的结构的和靶dna手机数据在线，钻研者从PubChem得到丁酸和丁酸酯的二维和三维立体的结构的（图1A）。凭借PharmMapper信息库和Uniprot信息库加工处理后共建立出114个丁酸靶dna供进第一步浅析。将dna列表框把手机通讯录STRING信息库，开始PPI手机数据在线浅析。Cytoscape得出了排顺的前20的联络线站靶dna的简要手机数据在线图，涉及CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这样的联络线站dna与手机数据在线中的任何dna均体现出有一定的对应性，详细说明这样的dna或许起到着一体化用。GO和KEGG浅析揭露了丁酸联络线站dna的对应条件和生态学技术学用（图1C）。联络线站dna主耍与类固醇雄性激素初次回复、钝化应激性不起用初次回复、特异性酶类氧細胞对类固醇雄性激素畅快的不起用并且对咸性物理化学东西的不起用有关于。综合上面的说明，这样的联络线站dna主耍参与性了钝化应激性不起用和对特异性酶类氧的生态学技术不起用步骤，是肾结石造成策略中至关关键的条件，这证明丁酸或许在肾结石中起到关键用。

图1| 丁酸架构与靶什么是基因网络数据阐述(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一次探讨丁酸对CaOx肾结石确凿切靶染色体遗传组组，研发工作者做好GEO参数统计库对GSE73680中键康比较与CaOx肾结石糖尿病提高的染色体遗传组组文化差异做好了研发。比较组与CaOx结石糖尿病提高的明显性文化差异把你想把你想展示出来出来染色体遗传组组（DEGs）筛分条件为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个染色体遗传组组造成明显改变，在其中3379个（89.4%）染色体遗传组组把你想把你想展示出来出来上浮，404个（10.6%）染色体遗传组组把你想把你想展示出来出来上涨（图2A）。对DEGs做好聚类分析法算法分享，热图显视了前10个被选中DEGs的二维分层次聚类分析法算法有特点（图2B）。自后，研发工作者用GeneCards参数统计库手动签别了370个有机会与CaOx肾结石有关系的染色体遗传组组，排民前20位的估计染色体遗传组组下列关于有关系性评价如图已知2C提示。考虑到遇到丁酸治疗方法CaOx肾结石的重要性靶点，研发工作者将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关系染色体遗传组组加工赢得了了个Venn图。结果是，CYP2C9被制定为丁酸会影响CaOx肾结石的存在靶点(图2D)。前者，研发工作者还做好了丁酸与CYP2C9的大分子联接，CYP2C9的这三个核苷酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸互相角色，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在再生利用微信网络药学学分折CYP2C9是丁酸损害CaOx肾结石的靶基因组后，的研究考生还使用上皮人体细胞实验所断定了CYP2C9可较低草酸引导的HK-2上皮人体细胞的ROS标准、炎症病变破损和凋亡。

图2| 部分据库综合了解預测CYP2C9是丁酸影响于CaOx肾结石的靶基因组

设计没想到

本探讨先要得知丁酸在离体和人体均能控制CaOx肾结石模特的脱色应激状态反应和细菌感染损坏，后来根据网咯药剂学学学挑选得出丁酸导致CaOx肾结石的风险靶点——CYP2C9，然后根据癌肿瘤细胞调查断定CYP2C9在草酸盐帮助的HK-2癌肿瘤细胞ROS技艺水平、细菌感染损坏和凋亡。许多得知阐明丁酸几率根据控制CYP2C9来控制CaOx肾结石的脱色应激状态反应，缓减细菌感染损坏。一种环节中拜谱生物学技艺提供了了网咯药剂学学学技艺的服务性，虽然拜谱生物学技艺可改善成熟稳重改进的基因遗传组学、核氨基酸组学、分解代谢组学等几组学厂品及技艺的服务性，热烈欢迎致电的方式网络咨询！ 参考资料专著：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.