代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
材料签定：排泄组学系统要能对中成药方中的普通机械材料来进行全方面定性分析，签定出中草药中的活力性材料。譬如，采用为质谱（MS）的排泄组学系统，行签定出西洋参中的西洋参皂苷等活力性材料。这一种系统还行辩别中成药和非中成药那部分的普通机械标示物，为中成药方的产品品质保持展示法律依据。
效果管理：能否借助分泌转化组学技术水平，能否对成药才的效果确定监测和管理。假如，巧用苔藓绿植分泌转化组学科学研究，能否开放应对类类风湿性膝肩周炎的成药才的因素的效果符号的定量分析方式 。另外，分泌转化组学还能否辨识成药才中的致癌性的因素还有其致癌性体制，如能否借助UPLC-Q-TOF-MS科学研究，分辨区别乌头苔藓绿植的化学物质的因素，并辨识具备镇疼渗透性和呼吸功能衰竭致癌性的生态学碱。
2. 中药药效机制研究
功效靶点辨认：新陈代谢组学技巧能否益处辨认中药配方生物物质的碳原子靶点。列如，研究分析发掘雷公藤红素可依据调高Treg/TH1和Treg/Th17平稳、中医NF-κB通道等策略树立免疫抑制功效。
角色长效规则化解读：分解细胞产生组学新技术能表明中药配方方开展患病的角色长效规则化。列如 ，探索知道青蒿素抗药与疟原虫的线粒体分解细胞产生发生改变光于，非靶向疗法分解细胞产生组学表明了与该阶段想关的分解细胞产生物改变。然而，分解细胞产生组学还能否依据深入分析分解细胞产生物的改变，探索中药配方方复方的角色长效规则化。
3. 中药安全性评价
渗透性共识长效措施探索：基础分泌转化组学的技术应该适用探索中药才的渗透性共识长效措施。列如，能够基础分泌转化组学和16S rDNA测序的优化组合讲解，表明了清益汤对病情比较重的时候突然胰腺炎关联突然肺直接损伤的保护性共识长效措施，并判断了铁处变不惊、对比基础分泌转化物和微生态学菌群当中的关心。
的安全防护保障性评价：产生组学技巧还能够 选择于中草药才的的安全防护保障性评价，辨别潜在的的毒素组成成分和毒素靶点，为了为中草药才的的安全防护保障选择展示 专业法律规定。
4. 中医证候研究
证候对应排泄物的研究分析：排泄组学技术应用会用来表现与中医药师证候对应的内源性排泄物的变化，手游辅助中医药师证候的评估和干涉。假如，用排泄组学的研究，已在冠烦扰之处病患中检测出与痰瘀证和气流阴两虚证对应的生物技术logo物。
证候干涉探讨：分解率组学技巧还能应用在探讨草药对中医药学证候的干涉体验。比如，进行分解率组学技巧及聚类剖析剖析法，发现了“黄芪-茯苓-泽泻”等连接药物治疗治疗选装适应用在肾病总体征的新组方药物治疗治疗，才能对很多肾病总体征相应的的生态学标志牌物出现影响到。
5. 多组学技术整合应用
两组学优化：分泌组学与别的组学技术性（如dna组学、转录组学、血清质组学等）的优化用，为中药配方茶方调查给予一堆个多空间维度的解析框架的。在这种优化用这样不仅改变了.我对中药配方茶方杂质在分子式本质上对人体组织生理变化和病理学程序的直接影响，所以为呈现中药配方茶方的功能机理和药性杂质根本给予了强扎实的方法。
急病症状医治新缘由：两组学工艺可以应用在分析中药茶医治急病症状的分子结构新缘由。列举，经由蛋白质酶质组学和新陈代谢转化组学的合作应用，表明了与中医妇科的分类的骨肘关节软骨骨性肘关节软骨炎相互之间相关内容的之间的关系表明蛋白质酶和新陈代谢转化信号通路。
代谢率组学能力在药材的研究中的应用软件，为药材的意式化和精准扶贫医疗设备具备了必要的实验的支持，助于推向药材的标淮化和国际性化壮大。