
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱微生物 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
的研究結果
科研员探讨不断地要在冷冻冷藏室保存时延迟羊肉的坚硬程度、持来说水力、亮光、自由铁分子量、ROS、脂质过被化合物、MDA、GSH和GPX4质量来鉴定胸肌阻止神经元的铁自杀情况。导致显现,要在冷冻冷藏室保存时延迟后,羊肉的坚硬程度在第8天和第6天正相关增涨;持水作用减小;彩色变深,损失亮光,鲜黄色换为暗黄色。与此同时,自由铁、生物氧和MDA的分子量正相关曾加,神经元凋亡率正相关上升。 设计职工领取与众有不一致性 冷库准确时间的手臂身体肌肉仿品的球膳食纤维,随后完成SDS-PAGE分折,球膳食纤维条带在与众有不一致性 晚清时期分布图制作匀且类似(图1a)。给出球蛋清在与众有不一致性 仿品中的表达方法症状,分折知道相同个组仿品的中个数将近于相同个含量(图1b),解释手臂身体肌肉仿品球膳食纤维拥有保持良好的组内类似性和组间不一致性性。 血清质组学共检测出1996种血清质。以B0为差表组,挑选B1、B2、B4和B6中的血清确定性别对比分析表述剖析,共检测到376个DEPs。将火山图可视化数据,并随FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05俩个标准的剖析DEP。可是图甲1c-f下图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别检测出22、33、73和140个DEPs,当中分头别调整6、11、32和8七个,下降16、22、41和5俩个。聚类算法手段分析评估了与众不同保鲜冷库的阶段身体脂肪进行中血清质的表述,可是体现 身体脂肪血清表述性别对比分析随保存时间间隔的加剧而加剧(图1g)。
图1| 各个冷藏箱时的力量土样血清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不相同冷藏箱时期的肌群样机区别蛋白质解析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁突然死亡蛋清肽的PRM降钙素原检测解析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 依据KEGG生物富集差别的展示蛋清的铁伤亡工作机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱动物提供了TMT降钙素原检测蛋白质酶质组学技术工艺性服務,拜谱生物工程已研发项目管理结束并建设了健全完善熟的转录组学、蛋白质酶组学、代谢率组学及其多个学综合食品技术工艺性服務机制,欢迎致电咨询!
规范文章:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.